Apa itu file NIfTI (.nii)?

Satu file, satu volume

NIfTI (Neuroimaging Informatics Technology Initiative) adalah format data MRI untuk riset. Jika alat pemindai di rumah sakit menulis DICOM — satu file per irisan, penuh data pasien — NIfTI menyimpan seluruh volume 3D dalam satu file, hanya dengan yang dibutuhkan analisis: ukuran grid, ukuran tiap voksel, dan posisi grid dalam ruang.

Nama file berakhiran .nii, atau .nii.gz jika dikompresi. Sebagian file berisi rangkaian volume dari waktu ke waktu (fMRI) atau dari berbagai arah (pencitraan difusi) — itu file 4D.

NIfTI-1 dan NIfTI-2

NIfTI-1 adalah versi yang umum. NIfTI-2 punya kolom yang sama dengan angka yang lebih besar, untuk gambar yang sangat besar. Keduanya diawali header tetap, sehingga program bisa membedakannya dari byte pertama.

Melihat isinya

Letakkan file di OsonKit. Ia membaca header dan volume pertama di browser Anda lalu menampilkan tiga bidang — aksial, koronal, dan sagital — dengan orientasi seperti yang dilihat radiolog: sisi kanan pasien di sebelah kiri layar.

• Ganti bidang dengan tombol Bidang; masing-masing terbuka di irisan tengahnya.
• Gulir antaririsan, seret untuk mengubah kontras, zoom dengan Ctrl + roda.
• Tag Volume menunjukkan ukuran grid, ukuran voksel, tipe data, dan orientasi.

File besar tidak masalah: hanya volume pertama yang dibaca, bahkan dari file terkompresi berukuran beberapa gigabyte. Di file 4D, yang Anda lihat adalah volume pertama itu.

Mengapa tempat membukanya penting

Data riset datang bersama formulir persetujuan dan perjanjian data yang jarang mengizinkan pengunggahan ke sembarang situs. Penampil yang berjalan di browser memungkinkan Anda memeriksa file — subjek yang benar, orientasi yang benar, tidak rusak — tanpa data meninggalkan komputer Anda.