NIfTI(.nii) 파일이란 무엇인가요?

파일 하나에 볼륨 하나

NIfTI(Neuroimaging Informatics Technology Initiative)는 연구용 MRI 데이터 형식입니다. 병원 장비가 슬라이스마다 파일 하나씩, 환자 정보가 가득한 DICOM을 쓰는 반면, NIfTI는 3D 볼륨 전체를 파일 하나에 담고 분석에 필요한 것만 기록합니다. 격자의 크기, 각 복셀의 크기, 격자가 공간에 놓인 방식입니다.

파일은 .nii로 끝나고, 압축되어 있으면 .nii.gz로 끝납니다. 시간에 따른(fMRI) 또는 방향에 따른(확산 영상) 여러 볼륨을 담은 파일도 있는데, 이것이 4D 파일입니다.

NIfTI-1과 NIfTI-2

NIfTI-1이 흔히 쓰이는 버전입니다. NIfTI-2는 아주 큰 영상을 위해 같은 필드를 더 큰 숫자로 담습니다. 둘 다 고정된 헤더로 시작하므로 프로그램은 처음 몇 바이트로 둘을 구별할 수 있습니다.

안을 들여다보기

파일을 OsonKit에 끌어다 놓으세요. 브라우저에서 헤더와 첫 번째 볼륨을 읽고 축상면, 관상면, 시상면의 세 단면을 영상의학과 의사가 보는 방향으로 보여 줍니다. 환자의 오른쪽이 화면 왼쪽입니다.

• 단면 버튼으로 단면을 바꿉니다. 각 단면은 가운데 슬라이스에서 열립니다.
• 슬라이스를 스크롤하고, 드래그로 대비를 바꾸고, Ctrl + 휠로 확대합니다.
• 볼륨 태그에서 격자 크기, 복셀 크기, 데이터 유형, 방향을 볼 수 있습니다.

큰 파일도 괜찮습니다. 수 GB의 압축 파일이라도 첫 번째 볼륨만 읽습니다. 4D 파일에서는 그 첫 번째 볼륨이 보입니다.

어디서 여느냐가 중요한 이유

연구 데이터에는 동의서와 데이터 이용 계약이 따르며, 아무 웹사이트에나 업로드하는 것을 허용하는 경우는 드뭅니다. 브라우저에서 작동하는 뷰어라면 데이터가 컴퓨터 밖으로 나가지 않은 채 파일을 확인할 수 있습니다. 대상자가 맞는지, 방향이 맞는지, 손상되지 않았는지.