NIfTI (.nii) dosyası nedir?

Bir dosya, bir hacim

NIfTI (Neuroimaging Informatics Technology Initiative), araştırmadaki MR verileri için bir formattır. Hastanedeki cihaz DICOM yazarken (her kesit için bir dosya, hasta bilgileriyle dolu) NIfTI bütün bir 3D hacmi tek bir dosyada tutar ve yalnızca analizin ihtiyaç duyduğunu saklar: ızgaranın boyutu, her vokselin boyutu ve ızgaranın uzaydaki konumu.

Dosya .nii ile, sıkıştırılmışsa .nii.gz ile biter. Bazı dosyalar zamana (fMRI) ya da yönlere (difüzyon görüntüleme) göre bir dizi hacim içerir: bu bir 4D dosyadır.

NIfTI-1 ve NIfTI-2

NIfTI-1 yaygın sürümdür. NIfTI-2 aynı alanlara sahiptir ama çok büyük görüntüler için daha büyük sayılar kullanır. İkisi de sabit bir başlıkla başlar, bu yüzden bir program onları ilk baytlardan ayırt edebilir.

İçine bakmak

Dosyayı OsonKit sayfasına bırakın. Başlığı ve ilk hacmi tarayıcınızda okur ve üç düzlemi (aksiyel, koronal ve sagittal) radyologların baktığı gibi yönlendirerek gösterir: hastanın sağ tarafı ekranın solunda.

• Düzlem düğmesiyle düzlemler arasında geçin; her biri ortadaki kesitiyle açılır.
• Kesitler arasında gezinin, kontrastı değiştirmek için sürükleyin, Ctrl + tekerlekle yakınlaştırın.
• Hacim etiketleri ızgara boyutunu, voksel boyutunu, veri türünü ve yönelimi gösterir.

Büyük dosyalar sorun değil: birkaç gigabaytlık sıkıştırılmış bir dosyada bile yalnızca ilk hacim okunur. 4D bir dosyada gördüğünüz de bu ilk hacimdir.

Nerede açtığınız neden önemli

Araştırma verileri, rastgele bir siteye yüklemeye nadiren izin veren onam formları ve veri sözleşmeleriyle gelir. Tarayıcıda çalışan bir görüntüleyici, veriler bilgisayarınızdan çıkmadan bir dosyayı (doğru katılımcı, doğru yönelim, bozuk olmadığı) kontrol etmenizi sağlar.